LC-MS/MS修飾位點鑒定
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發(fā)布時間:2025-07-25 08:49:03 更新時間:2025-08-28 10:27:06
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作者:中科光析科學技術(shù)研究所檢測中心
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LC-MS/MS修飾位點鑒定是使用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(LC-MS/MS)來確定蛋白質(zhì)或肽段上的特定化學修飾位置的方法。這包括磷酸化、糖基化、泛素化等多種生物學上重要的修飾。這種技術(shù)對于了解蛋白質(zhì)功能、蛋白質(zhì)相互作用、信號傳導路徑以及疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的變化尤為重要。
修飾位點鑒定的基本步驟包括:
樣品準備:蛋白質(zhì)或肽段樣品經(jīng)過提取和純化,可能還包括特定修飾富集的步驟,以增加檢測到特定修飾的可能性。
液相色譜分離:通過液相色譜將樣品中的肽段進行分離,以減少樣品復雜度并提高后續(xù)質(zhì)譜分析的準確性。
質(zhì)譜分析:肽段在質(zhì)譜儀中被電離并測量其質(zhì)荷比(m/z)。特定肽段被選擇進行進一步的碎裂(MS/MS),產(chǎn)生一系列的碎片離子,這有助于識別修飾的準確位置。
數(shù)據(jù)分析:使用特定的軟件分析MS/MS數(shù)據(jù),對碎片離子進行識別和序列分配,從而確定肽段上的修飾位置。軟件分析通常依賴于數(shù)據(jù)庫搜索或譜圖匹配。
通過LC-MS/MS鑒定修飾位點,研究人員可以獲得有關(guān)蛋白質(zhì)如何在不同生物學條件下被修飾的詳細信息,這對于理解細胞內(nèi)信號傳遞、蛋白質(zhì)功能及其在疾病中的角色至關(guān)重要。
通過液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(LC-MS/MS)結(jié)合數(shù)據(jù)庫檢索進行蛋白質(zhì)修飾位點的鑒定,實際上是蛋白質(zhì)組學研究中的一項強大技術(shù)。它不僅可以鑒定蛋白質(zhì)序列和表達量,還能檢測和定量蛋白質(zhì)上的各種化學修飾,如磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化、琥珀酰化等。此外,一些特殊的小分子藥物修飾也可以通過這種方法被鑒定。這對于深入理解蛋白質(zhì)功能、調(diào)控機制及其在疾病中的作用至關(guān)重要。
為了提高特定蛋白質(zhì)修飾位點檢測的準確性和靈敏度,樣品前處理過程中的蛋白質(zhì)或肽段的純化與富集是非常重要的步驟。這可以通過多種方法實現(xiàn),包括:
免疫沉淀(IP):使用針對目的蛋白或特定修飾的抗體進行富集。
親和純化:利用蛋白質(zhì)或其修飾與某些固定相之間的特異性親和作用進行純化。
SDS-PAGE:通過電泳分離基于大小的蛋白質(zhì),然后進行切割和進一步分析。
結(jié)合這些富集和純化技術(shù),可以顯著提高目標蛋白修飾位點檢測的選擇性和靈敏度。通過LC-MS/MS分析和數(shù)據(jù)庫檢索,可以準確鑒定蛋白質(zhì)序列中的特定修飾位點,包括上述提到的多種化學修飾類型。這種方法的強大之處在于它的多功能性和高通量能力,能夠在單一實驗中檢測多達8種甚至更多已知的蛋白質(zhì)修飾類型。
綜上所述,LC-MS/MS結(jié)合先進的樣品處理技術(shù),為蛋白質(zhì)修飾位點的高效鑒定提供了強大的工具,這對于推進生物學研究和藥物開發(fā)具有重要意義。
證書編號:241520345370
證書編號:CNAS L22006
證書編號:ISO9001-2024001
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