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TMT 標記蛋白質(zhì)組

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發(fā)布時間：2025-07-25 08:49:03 更新時間：2025-08-28 10:27:05

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作者：中科光析科學技術研究所檢測中心

　　TMT(Tandem Mass Tags)是由美國Thermo公司研發(fā)的體外同重同位素標記的定量技術。該技術采用10-plex或16-plex標記試劑，可以同時比較10組或16組樣本之間的蛋白表達差異。TMT同位素試劑標記多肽氨基基團后，等量混勻多肽并進行LC-MS/MS分析。一級質(zhì)譜中，不同樣品來源的同一肽段表現(xiàn)出相同的m/Z;二級質(zhì)譜中，化學鍵斷裂釋放出報告離子，低質(zhì)量區(qū)的報告離子強度反映了該肽段在不同樣品中的相對表達量，高質(zhì)量區(qū)的肽段碎片離子m/Z反映了該肽段的序列信息。質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)經(jīng)過數(shù)據(jù)庫檢索，即可得到樣本中所含蛋白及其表達差異。

數(shù)據(jù)分析

標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容
鑒定分析	鑒定與定量結果統(tǒng)計；單個樣本蛋白質(zhì)鑒定結果統(tǒng)計；韋恩圖
表達差異分析	差異結果統(tǒng)計；差異結果柱狀圖；火山圖；聚類分析圖；
多組的比較分析（組別>=3）	mufzz聚類；雷達圖；箱線圖
功能分析	亞細胞定位；結構域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作網(wǎng)絡分析
質(zhì)量控制分析	肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白質(zhì)豐度比分布
高級數(shù)據(jù)分析
功能分析	GSEA富集分析
臨床藥物研究	藥物靶點注釋
標志物篩選	集成機器學習
與臨床表征的聯(lián)合分析	熱圖；弦圖；ROC分析；WGCNA分析

· 推薦應用領域

1. 農(nóng)林領域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等

2. 畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等

3. 基礎醫(yī)學、臨床診斷：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治療等

4. 生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等

5. 微生物領域：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等

6. 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等

7. 生物能源、環(huán)境科學領域：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危定風險評估研究等

8. 食品營養(yǎng)：食品儲藏及加工條件優(yōu)化，食品組分及品質(zhì)鑒定，功能性食品開發(fā)，食品安全監(jiān)檢測等

· 送樣建議

樣品類型		推薦樣本量
動物組織類	常規(guī)動物組織（腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、皮膚等）	≥30mg
植物組織類	柔軟組織（木本植物的葉、花等，草本科植物，藻類，蕨類植物，大型真菌等）	≥100mg
微生物類	菌類	≥50mg
細胞樣品	懸浮/貼壁培養(yǎng)細胞	≥1 × 10^7
體液樣本	血清/血漿	≥100μL
外泌體	提取完成的外泌體	≥100μg
其他類	細胞上清	≥5mL