長非編碼RNA（lncRNA）在許多重要的生物過程中起著關鍵作用，包括發育、疾病和癌癥。但是，這些lncRNAs在單細胞水平上的表達和功能尚不清楚。為了更好地理解這些lncRNAs在單細胞水平上的表達和功能，可以采用靶向lncRNA的單細胞全轉錄組測序技術。

這種技術的步驟可能包括：

1. 單細胞分離：使用流式細胞儀或微流控技術將單個細胞分離出來。
2. RNA提取：使用高效的RNA提取方法，從單個細胞中提取RNA。
3. 靶向擴增：設計特定的引物，只擴增感興趣的lncRNA，或者使用特定的RNA探針靶向捕獲這些lncRNA。
4. cDNA合成：使用逆轉錄酶將RNA轉化為cDNA。
5. 庫構建和測序：使用特定的測序庫構建方案，如Illumina或者10x Genomics，構建測序庫，并進行測序。
6. 數據分析：使用專門的生物信息學工具，如STAR，HISAT2等進行比對，然后使用cufflinks，StringTie等進行轉錄本的重建和定量。最后，可以使用PCA，t-SNE，UMAP等工具進行數據的可視化分析。

這種方法可以幫助研究者理解在某些特定細胞中，特定的lncRNA是如何表達的，以及這些lncRNA可能如何影響細胞的功能。

長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一類長度大于200nt，沒有蛋白質編碼能力，或只能編碼短肽的RNA分子。在過去的幾十年中，研究者們逐漸認識到lncRNA的重要性，發現lncRNA在細胞分化、生長發育、免疫應答、基因轉錄調控、RNA加工修飾等方面具有重要的調節作用^[1-4]。然而，由于lncRNA的豐度普遍較低，一般只有mRNA的十分之一左右^[5]。傳統的測序技術包括單細胞測序技術在低豐度轉錄本（比如lncRNA）的檢測上存在靈敏度不高和檢測不準確等問題，在測序建庫過程中，對低豐度的轉錄本進行特異性的靶向擴增，則可以實現對這些轉錄本更靈敏、更準確的檢測。為此，我們設計了針對lncRNA的靶向panel，包含315個和148個已報道的，與人或小鼠生物學功能或疾病相關的功能性lncRNA。在單細胞測序建庫過程中，使用lncRNA靶向panel對功能性lncRNA分子進行多重PCR擴增，極大的提高了lncRNA的檢測靈敏度和準確性，使得在單細胞水平分析低豐度、功能性lncRNA表達情況成為可能。

檢測機構資質證書

CMA認證

檢驗檢測機構資質認定證書

證書編號：241520345370

有效期至：2030年4月15日

CNAS認可

實驗室認可證書

證書編號：CNAS L22006

有效期至：2030年12月1日

ISO認證

質量管理體系認證證書

證書編號：ISO9001-2024001

有效期至：2027年12月31日

關于我們

部分儀器

合作客戶